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卓越平臺 | 發掘蛋白可開發性的寶藏路徑:in-silico預測與表征驗證

發布日期:2023-06-19

藥物可開發性研究是一種風險評估和風險緩解措施,旨在將候選物高概率地開發成臨床醫學中可用的藥物。在此開發過程中,為了高效低成本篩選出低風險候選分子進入CMC開發階段,可以利用多信息平臺In-silico預測分析,以極低的成本獲取靶蛋白結構、物理、化學性質和潛在風險信息,設計針對性的表征實驗加以驗證,確保以合理的成本和時間線內順利通過化學、生產和控制流程(CMC)。

本文將簡單展示行業內通用可開發性策略,結合漢騰生物in-silico分析平臺,對創新蛋白分子可開發性評估中的具體工作梳理一些思路。

In-silico預測數據全流程支持藥物可開發性研究

In-silico使用分子信息學對候選分子的物理化學屬性、結構、聚集傾向、翻譯后修飾、穩定性和免疫原性的預測信息,能夠有效對候選藥物分子進行排序,篩選,定向優化改造,提供潛在風險的早期提示,幫助我們及時調整開發策略,如調整上下游工藝和制劑配方開發,以解決潛在問題。



In-silico分析助力分子篩選和優化

In-silico分析基本流程

基于序列分析和3D空間結構測量,能夠獲得蛋白分子量、等電點、消光系數、二硫鍵、游離巰基、糖基化等信息,進一步對潛在風險翻譯后修飾、分子完整性、聚集性、疏水性等屬性進行預測。3D可視化能夠加深對功能位點和作用機制的深刻理解,結合平臺經驗,進行風險識別和應對策略評估,此外結構和分子背景的全面科學理解,對上下游工藝,分析方法,制劑開發能提供有力參考。



漢騰生物in-silico分析流程



漢騰生物in-silico常用工具

表征驗證平臺
漢騰理化分析和生化分析平臺具備成熟的藥物可開發性研究策略和分析評估經驗,利用in-silico對候選物的屬性預測,針對性設計關鍵表征分析實驗,能夠低成本、高效率以及高準確度地對候選分子的可開發性潛力進行評估。


漢騰生物in-silico數據驗證方案

IgM 開發實例
IgM是人體第一道天然免疫屏障中關鍵的免疫球蛋白,能夠結合補體,殺菌,溶菌,中和病毒對抗病原體入侵。天然IgM分子量巨大,血清中以900KD大小的五聚體形式存在,具有重組表達量低,溶解度低,穩定性差等歷史難題,但漢騰生物IgMax平臺成功克服以上困難,已協助多個客戶完成IND研究。

在此之前漢騰分析團隊對已對IgM的聚集體形式、二硫鍵、游離巰基、氨基酸序列、翻譯后修飾、N-糖基化位點、假病毒中和活性等進行in-silico預測和全面的表征驗證工作,獲得其五聚體含J鏈的構型、98對二硫鍵、2個游離巰基、51個N-糖位點、各位點優勢糖型和空間功能的全面屬性揭示。大大加快了IgM在生物制藥領域的應用進度。


IgM模式圖




in-silico自由巰基的3D預測和表征驗證方案

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